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我国农业科学院作科所构建谷子形式种类定向骤变挑选数据库
来源:火狐官方站点    发布时间:2025-04-01 03:14:33

  3月3日,我国农业科学院作物科学研讨所特征农作物优异种质资源开掘与立异使用团队,构建了谷子形式种类Ci846的基因组饱满骤变体库及定向骤变挑选网络数据库,为谷子功用基因组研讨和分子规划育种供给了高效研讨东西。相关研讨效果在线宣布在《植物生物技能(Plant Biotechnology Journal)》上。

  谷子是起源于我国的禾谷类特征杂粮作物,因其具有基因组小、基因组的重复序列少、二倍体单穗结实多、便于繁衍、C4高光效等特色,近年来正在发展为解析作物形状建成、性状构成机理的形式作物,而谷子地方种类资源Ci846是抱负的基因功用研讨形式资料,具有成长周期短、便于室内高效扩繁的优势,被很多科学家认定为谷子基础研讨的形式种类。因而,使用形式种类完成谷子方针基因骤变资料的快速获取,是加强完善谷子形式研讨渠道的要害。

  研讨团队使用化学诱变结合高通量基因型辨别断定技能,构建了一个包括9243个诱变2代植株的Ci846大型EMS诱变骤变体库,在此基础上对4109株诱变2代植株基因组测序构成现在已报导规划最大的骤变体基因型数据调集,并将有关数据整合构建了网络查询数据库()。据统计,该数据库变异位点达到了2,899,449个,基因组均匀骤变密度为1/29.70 Kb,覆盖了已报导的一切谷子功用基因。进一步使用该骤变体库和基因型数据库,完成了谷子极早熟基因 SiPHYB 和黄绿叶基因 SiYGL1 的快速发掘,证明该渠道展开方针基因快速定向挑选和基因组学研讨的可行性和高效性。

  作科所博士研讨生张慧、梁红凯为论文的一起榜首作者,贾冠清研讨员、刁现民研讨员和贺强研讨员为论文的一起通讯作者。该研讨得到国家重点研制方案、农业生物育种专项、国家天然科学基金、作物基因资源与育种全国重点实验室、国家谷子高粱工业技能系统、我国农业科学院青创专项等项目的赞助。

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